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银行短信通知费用一般计入企业的财务费用科目。财务费用是指企业为筹集生产经营所需资金而发生的费用，包括利息净支出、汇兑净损失、金融机构手续费等。关于银行短信通知费用的会计处理，可以进一步分为以下几个步骤。
1、当企业收到银行扣收短信通知的费用通知时，需要在财务费用科目下进行记账。
2、具体记账时，应借记“财务费用-手续费”科目，这是针对企业支付的各种银行费用（如利息净支出、汇兑损益和银行手续费等）的会计处理。
3、贷记“银行存款”科目，表示企业银行账户的资金减少，通过这样的记账方式，企业能够清晰地追踪银行短信通知费用的支出情况，并确保财务记录的准确性。
仅供参考，具体会计处理可能因企业实际情况而异，如果需要更专业的指导，建议咨询专业财务人员或会计师。